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MPICH2


* 前提条件 [#a176d920]
MPICHとかなり設定が違うので注意。
- [[NIS]]がインスト−ル済み
- [[NFS>NFS/autofs]]がインスト−ル済みで/homeが共有されている.
- [[rsh]]がインスト−ル済みでuserからrshが使えることが確認されている.

* MPICH for ifort [#h968dc22]
CentOS 5.2
* Install [#d2979a25]
 ./configure --prefix=/usr/local/mpich2
 make
 make install

* 設定 [#x475c233]
** PATH [#ke327f6b]
mpich2/binにpathが通っていればOK.
setenv PATH /usr/local/local/mpich2/bin
** bin/mpdbootの修正(rshを使う場合) [#oa3cff23]
    rshCmd = 'ssh'
    ↓
    rshCmd = 'rsh'

** mpd.conf [#s90be690]
以下のファイルを用意
- /etc/mpd.conf
- /home/XXX/.mpd.conf
- 内容
  secretword=<secretword>
- アクセス権
  chmod 600 .mpd.conf
** check [#n09cd15d]
 mpd &
 mpdtrace
 mpdallexit
エラーが表示されなければOK
** mpd.hostsの用意 (MPICHのmachine.LINUXに相当) [#uf1ba234]
例)
 localhost
 or
 localhost: 2 ?????

** テスト [#v0f2c260]
*** テスト mpd [#r56b56bd]
 mpdringtest
 mpdringtest 100
 mpdringtest 1000

*** テスト mpiexec [#m4d530eb]
 mpiexec -n 2 cpi


* 運用 [#lb6b2e58]
** 1台で動かす [#ec5f1355]
+ mpd &
+ mpiexec -n 2 ./cpi
+ mpiallexit
** 複数台で動かす [#vdae7dfd]
+ mpdbootをノードを起動,X台で並列
--  mpdboot -f mpd.hosts -n X
+ mpdtraceで確認
+ mpiexecでノード数を指定してジョブを実行
-- mpiexec -n 6 ./cpi
--- current directoryは考慮されないので,"./"がないとエラーになる
- 1,2は起動時に実施すれば,ログアウトまで実行する必要無し.

* Command [#r0759908]
- mpd &
- mpdallexit
- mpdclear
- mpdtrace
- mpdboot
- mpiexec


* Trouble [#ica22308]
*** mpdboodがエラーで起動しない場合 [#e3820e61]
- 以下のファイルがロックされている可能性がある.削除すると動く
-- /tmp/mpd2* 


** Link [#l07eee68]
- [[MPICH本家:http://www-unix.mcs.anl.gov/mpi/mpich1/]]

- http://pccluster.web.fc2.com/MPI.html
- http://ameblo.jp/hamubane/entry-10165568392.html