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Top/MPICH2 hydra
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- 1 (2013-01-05 (土) 13:00:20)
- 2 (2013-01-05 (土) 13:08:52)
- 3 (2013-01-08 (火) 15:30:58)
- 4 (2013-04-24 (水) 14:49:02)
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* 前提条件 [#fc4e812a] MPICHとかなり設定が違うので注意。 - [[NIS]]がインスト−ル済み - [[NFS>NFS/autofs]]がインスト−ル済みで/homeが共有されている． - [[rsh]]がインスト−ル済みでuserからrshが使えることが確認されている． * Install [#f19028b3] ./configure --prefix=/usr/local/mpich2 make make install * 設定 [#y7ab023d] ** PATH [#l45a84d6] mpich2/binにpathが通っていればOK. setenv PATH /usr/local/local/mpich2/bin ** bin/mpdbootの修正(rshを使う場合) [#db0956f8] rshCmd = 'ssh' ↓ rshCmd = 'rsh' ** mpd.conf [#k0c3c057] 以下のファイルを用意 - /etc/mpd.conf - /home/XXX/.mpd.conf - 内容 secretword=<secretword> - アクセス権 chmod 600 .mpd.conf ** check [#zfd236dd] mpd & mpdtrace mpdallexit エラーが表示されなければOK ** mpd.hostsの用意 （MPICHのmachine.LINUXに相当） [#gb6248e2] 例） localhost or localhost: 2 ????? ** テスト [#o6c9233b] *** テスト mpd [#j748db85] mpdringtest mpdringtest 100 mpdringtest 1000 *** テスト mpiexec [#q3d92702] mpiexec -n 2 cpi * 運用 [#x4c38fe7] ** １台で動かす [#h6c31acb] + mpd & + mpiexec -n 2 ./cpi + mpiallexit ** 複数台で動かす [#h8f3dd98] + mpdbootをノードを起動，X台で並列 -- mpdboot -f mpd.hosts -n X + mpdtraceで確認 + mpiexecでノード数を指定してジョブを実行 -- mpiexec -n 6 ./cpi --- current directoryは考慮されないので，"./"がないとエラーになる - 1,2は起動時に実施すれば，ログアウトまで実行する必要無し． * Command [#oc5f33c1] - mpd & - mpdallexit - mpdclear - mpdtrace - mpdboot - mpiexec * Trouble [#l6a4932a] *** mpdboodがエラーで起動しない場合 [#g4fa9250] - 以下のファイルがロックされている可能性がある．削除すると動く -- /tmp/mpd2* ** Link [#x71152ee] - [[MPICH本家:http://www-unix.mcs.anl.gov/mpi/mpich1/]] - http://pccluster.web.fc2.com/MPI.html - http://ameblo.jp/hamubane/entry-10165568392.html
