Navigation : Top/MATALB/mexncおよびsnctoolsのインストール

Linuxの場合 †

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2008b †

2008bからエンジン(DLL)はMATLABの本体を使用する．このため，インストールがとても簡単になった．

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ダウンロード †

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インストール †

  • 伸長して適当なところにおいてパスを通す． 
    	C:\Users\mori\src\matlab\mexcdf
	C:\Users\mori\src\matlab\mexcdf\mexnc
	C:\Users\mori\src\matlab\mexcdf\netcdf_toolbox
	C:\Users\mori\src\matlab\mexcdf\netcdf_toolbox\netcdf
	C:\Users\mori\src\matlab\mexcdf\netcdf_toolbox\netcdf\ncsource
	C:\Users\mori\src\matlab\mexcdf\netcdf_toolbox\netcdf\nctype
	C:\Users\mori\src\matlab\mexcdf\netcdf_toolbox\netcdf\ncutility
	C:\Users\mori\src\matlab\mexcdf\snctools
  • 確認 
    >> setpref('SNCTOOLS','PRESERVE_FVD',true); <- 配列のオーダーが変わった（デフォルト）
or
>> setpref('SNCTOOLS','PRESERVE_FVD',false); <- 配列のオーダーを昔に
>> nc_dump('example.nc')
netcdf example.nc { 

dimensions:
	x = 50 ;
	y = 50 ;
	z = 5 ;
	t = UNLIMITED ; (0 currently)


variables:
	double avagadros_number([]), shape = [1]
		avagadros_number:description = "this variable has no dimensions" 
	short temperature(x), shape = [50]
		temperature:scale_factor = 1.8 
		temperature:add_offset = 32 
		temperature:units = "degrees_fahrenheit" 
		temperature:description = "F = 9/5*C + 32" 
	float peaks(x,y), shape = [50 50]
		peaks:description = "z = peaks(50);" 
	long time_series(z,t), shape = [5 0]
		time_series:description = "this variable has an unlimited  dimension" 


//global attributes:
		:creation_date = "09-Jun-2008"
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2007b †

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ダウンロード †

http://mexcdf.sourceforge.net

  1. mexcdf.tar.gz をダウンロード
  2. snctools-X.zip をダウンロード
  3. netcdf_toolbox-1.XX.tar.gzをダウンロード
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mexncのインストール †

  • mexcdf.tar.gzを解凍し、mexncの下にあるmakefileをコンパイルする．
  • ifortの環境ではmexopts.shに以下の変更が必要 
    CC='icc'    
NETCDF="/usr/local/netcdf-ifort"
  • mexncを生成．
    • make -f makefile
  • test 
    >> mexnc ( 'STRERROR', 0 )
ans =
No error
    ! 注意） 環境に合わせてmexopt.sh（サンプル）の編集が必要
    • tests/test_mexnc.mを実施して，動作確認
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snctoolsのインストール †

  • unzip snctools-X.zip
  • pathを定義する．
  • tests/test_snctoos.mを実施して，動作確認
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mexcdf and snctoolsの仕上げ †

  • UnidataからtoolsUI version 2.2.18 (don't use 4.0)をダウンロード． 
    >> javaaddpath ( '/home/jevans/matlab/classes/toolsUI-2.2.18.jar' ) ; 
>> setpref ( 'SNCTOOLS', 'USE_JAVA', true ); % this requires SNCTOOLS 2.4.3 or better
  • USGS作成のマニュアル
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NetCDF Toolboxのインストール †

  • netcdf_toolbox-1.XX.tar.gzを解凍し以下のディレクトリーにパスを通す．
  • addpath /path/to/wherever/you/installed/this/netcdf
  • addpath /path/to/wherever/you/installed/this/netcdf/nctype
  • addpath /path/to/wherever/you/installed/this/netcdf/ncutility
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Windows †

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2007b †

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ダウンロード †

http://mexcdf.sourceforge.net

  1. mexcdf.tar.gz をダウンロード
    • 2.0.xのバージョンからLinux/Windows等すべて共通のファイルになった．
  2. snctools-X.zip をダウンロード
  3. netcdf_toolbox-1.XX.tar.gzをダウンロード
  4. netcdf-javaのtoolsUI.jarをダウンロード
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mexncのインストール †

  • mexcdf.tar.gzを解凍し，netcdf.dllをmatlabのパスの通る場所におく
    • 例）C:\Users\mori\src\matlab\matlab_public\netcdf
    • mexcdfをaddpathする
    • tests/test_mexnc.mを実施して，動作確認
      • この時点ではjavaの設定をしていないので一部エラーが出る． 
        >> mexnc ( 'STRERROR', 0 )
ans =
No error
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snctoolsのインストール †

解凍してパスを通すだけ

  • unzip snctools-X.zip
  • pathを定義する．
  • tests/test_snctoos.mを実施して，動作確認
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toolsUIのインストール †

  • UnidataからtoolsUI version 2.2.18 (don't use 4.0)をダウンロード． 
    >> javaaddpath ( '/C:\Users\mori\src\matlab\matlab_public\netcdf/toolsUI-2.2.18.jar' ) ; 
>> setpref ( 'SNCTOOLS', 'USE_JAVA', true ); % this requires SNCTOOLS 2.4.3 or better
  • もう一度テストする
    • tests/test_mexnc.mを実施して，Java関係の動作確認
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NetCDF Toolboxのインストール †

startup.mに以下を記述する。

addpath /usr/local/matlab7/toolbox/mexnc
addpath /usr/local/matlab7/toolbox/netcdf_toolbox
addpath /usr/local/matlab7/toolbox/netcdf_toolbox/nctype
addpath /usr/local/matlab7/toolbox/netcdf_toolbox/ncutility

matlabを起動し、mexnc/test/test_mexnxを実行するとテストプログラムが起動する。 ちゃんと起動したら、正しくインストールされたことになる。

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