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* 利用方法 [#v5b37d85]
- jobの投入
-- qsub XXX.sh
- jobの状態を表示
-- qstat （自分のだけ）
-- qstat -f （全プロセス）
- jobを削除
-- qsub XXX (job番号XXXを削除)
- hostの情報を表示
-- qhost
* SGEでMPICH2を使う [#af06917a]
- コマンドラインでmpdをboot
mpdboot -n XXX(number of nodes) -f ~/mpd.hosts
シェルの例１
#!/bin/bash
#$ -S /bin/bash
#$ -cwd
#$ -pe mpich 16
#$ -o run.log
export MPICH2_HOME=/opt/mpich2-intel
export MPICH2_BIN=$MPICH2_HOME/bin
export MPICH2_CONF="$HOME/mpd.hosts"
export APP="/home/mori/bin/cpi"
$MPICH2_BIN/mpiexec -n 16 -machinefile $MPICH2_CONF $APP
シェルの例２
#!/bin/bash
#$ -S /bin/bash
#$ -cwd
#$ -pe mpich 16
#$ -o run.log
#$ -j y
export MPICH2_HOME=/opt/mpich2-intel
export MPICH2_BIN=$MPICH2_HOME/bin
export MPICH2_CONF="$HOME/mpd.hosts"
export APP="/home/mori/bin/cpi"
# start mpd
$MPICH2_BIN/mpdboot -n "$NHOSTS" -f "MPICH2_CONF"
$MPICH2_BIN/mpiexec -n 16 -machinefile $MPICH2_CONF $APP
# stop mpd
jobs=`$MPICH2_BIN/mpdlistjobs`
if [ X"$jobs" = X ]; then
$MPICH2_BIN/mpdallexit
fi
* Link [#mbf887f9]
- [[Sun Grid Engine:http://jp.sun.com/products/software/gridware/]]
- [[SGE document:http://wikis.sun.com/display/GridEngineJA/Grid+Engine]] (wiki)
** User [#fdea3334]
- http://solar-b.nao.ac.jp/hinode_wiki/index.php?SBSC-PC%A5%AF%A5%E9%A5%B9%A5%BF%A1%BC%20%A5%E6%A1%BC%A5%B6%A1%BC%A5%BA%A5%DE%A5%CB%A5%E5%A5%A2%A5%EB
- https://supcom.hgc.jp/japanese/utili_info/manual/sge.html
- http://tera.thaigrid.or.th/drupal/en/user_manual/mpich2
